Preview

Альманах клинической медицины

Расширенный поиск

Антибиотикорезистентность культур Enterococcus spp., выделенных от промышленной птицы в 2013–2016 гг. в хозяйствах Российской Федерации, и детекция у них генов резистентности к ванкомицину

https://doi.org/10.18786/2072-0505-2017-45-2-138-146

Полный текст:

Аннотация

Актуальность. Энтерококки – ведущая причина ряда внутрибольничных и  внебольничных заболеваний человека. В  последнее десятилетие эти патогены приобретают устойчивость к  антибактериальным препаратам, в  том числе к  ванкомицину. Энтерококки с  множественной лекарственной устойчивостью выделяются также от сельскохозяйственных животных во многих странах мира, что вызывает настороженность ученых из-за возможного горизонтального переноса генетических детерминант резистентности. Цель  – определить чувствительность к  антибактериальным препаратам изолятов Enterococcus spp., выделенных от промышленной птицы в  Российской Федерации в  2013–2016  гг., детектировать в  их геномах гены устойчивости к  ванкомицину. Материал и  методы. Восемьдесят семь изолятов энтерококков, принадлежащих к  E.  faecalis (n = 47, 54%), E.  faecium (n = 25, 28,7%) и  другим видам (n = 15, 17,2%), выделены из клинических образцов 297  голов промышленной птицы (печень, легкие, сердце, селезенка, содержимое пазух носовых синусов) из 17  птицеводческих хозяйств Северо-Западного, Центрального, Приволжского, Уральского и  Южного федеральных округов Российской Федерации. Чувствительность энтерококков к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом и  методом микроразведений в  бульоне. Гены устойчивости к  ванкомицину (van) выявляли методом полимеразной цепной реакции со специфичными праймерами. Результаты. Большинство изолятов энтерококков были устойчивы к  эритромицину (74  из 87, 85,1%), гентамицину (70 из 87, 80,5%), цефтриаксону (61 из 87, 70,1%), ципрофлоксацину (56 из 87, 64,4%), тетрациклину (57 из 87, 65,5%) и рифампицину (48 из 87, 55,2%), а также к триметоприму (38 из 87, 43,7%), ампициллину (28 из 87, 32,2%), линезолиду (15  из 87, 17,2%) и  хлорамфениколу (5 из 87, 5,7%). У 10 изолятов были обнаружены гены типа vanC (vanC1 и vanC2/3). Минимальные подавляющие концентрации ванкомицина для этих изолятов составили 2–8 мг/л. Выделение от птицы и  идентификация изолята E.  faecium с  геном vanC1, по всей вероятности, является первым в  мировой практике. Заключение. Промышленная птица птицефабрик Российской Федерации – важный резервуар и источник антибиотикорезистентных популяций энтерококков, в том числе энтерококков с генами ванкомицинрезистентности vanC1 и vanC2/3

Об авторах

Э. А. Светоч
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Светоч Эдуард Арсеньевич – д-р вет. наук, профессор, гл. науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



М. Г. Теймуразов
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Теймуразов Марат Георгиевич – канд. биол. наук, ст. науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



О. И. Тазина
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Тазина Ольга Ивановна – лаборант-исследователь лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



А. А. Абаимова
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Абаимова Алена Алексеевна – стажер-исследователь лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



А. И. Лев
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Лев Анастасия Игоревна – мл. науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Е. И. Асташкин
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Асташкин Евгений Ильич – канд. мед. наук, вед. науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Е. С. Леонова
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Леонова Екатерина Сергеевна – стажер-исследователь лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Н. Н. Карцев
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Карцев Николай Николаевич – науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



К. В. Детушев
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Детушев Константин Владимирович – науч. сотр. отдела коллекционных культур 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Б. В. Ерусланов
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Ерусланов Борис Васильевич – вед. науч. сотр. лаборатории антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск, 



И. А. Дятлов
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Дятлов Иван Алексеевич – д-р мед. наук, профессор, академик РАН, директор 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Н. К. Фурсова
ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора
Россия

Фурсова Надежда Константиновна – канд. биол. наук, заведующая лабораторией антимикробных препаратов 

142279, Московская область, Серпуховский район, п. Оболенск



Список литературы

1. Murray BE. The life and times of the Enterococcus. Clin Microbiol Rev. 1990;3(1):46–65. doi: 10.1128/CMR.3.1.46.

2. Poulsen LL, Bisgaard M, Son NT, Trung NV, An HM, Dalsgaard A. Enterococcus faecalis clones in poultry and in humans with urinary tract infections, Vietnam. Emerg Infect Dis. 2012;18(7):1096–100. doi:10.3201/eid1807.111754.

3. Velkers FC, van de Graaf-Bloois L, Wagenaar JA, Westendorp ST, van Bergen MA, Dwars RM, Landman WJ. Enterococcus hirae-associated endocarditis outbreaks in broiler flocks: clinical and pathological characteristics and molecular epidemiology. Vet Q. 2011;31(1):3–17. doi:10.1080/01652176.2011.570107.

4. Nowakiewicz A, Ziółkowska G, Trościańczyk A, Zięba P, Gnat S. Determination of resistance and virulence genes in Enterococcus faecalis and E. faecium strains isolated from poultry and their genotypic characterization by ADSRRS-fingerprinting. Poult Sci. 2016. pii: pew365. doi:10.3382/ps/pew365.

5. Getachew Y, Hassan L, Zakaria Z, Abdul Aziz S. Genetic variability of vancomycin-resistant Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis isolates from humans, chickens, and pigs in Malaysia. Appl Environ Microbiol. 2013;79(15): 4528–33. doi:10.1128/AEM.00650-13.

6. Ali SA, Hasan KA, Bin Asif H, Abbasi A. Environmental enterococci: I. Prevalence of virulence, antibiotic resistance and species distribution in poultry and its related environment in Karachi, Pakistan. Lett Appl Microbiol. 2013;58(5): 423–32. doi:10.1111/lam.12208.

7. Diarra MS, Rempel H, Champagne J, Masson L, Pritchard J, Topp E. Distribution of antimicrobial resistance and virulence genes in Enterococcus spp. and characterization of isolates from broiler chickens. Appl Environ Microbiol. 2010;76(24):8033–43. doi:10.1128/AEM.01545-10.

8. Ellerbroek L, Mac KN, Peters J, Hultquist L. Hazard potential from antibiotic-resistant commensals like Enterococci. J Vet Med B Infect Dis Vet Public Health. 2004;51(8–9):393–9. doi:10.1111/j.1439-0450.2004.00782.x.

9. Giridhara Upadhyaya PM, Ravikumar KL, Umapathy BL. Review of virulence factors of Enterococcus: an emerging nosocomial pathogen. Indian J Med Microbiol. 2009;27(4):301–5. doi:10.4103/0255-0857.55437.

10. van Schaik W, Willems RJ. Genome-based insights into the evolution of enterococci. Clin Microbiol Infect. 2010;16(6):527–32. doi:10.1111/j.1469-0691.2010.03201.x.

11. Leclercq R, Derlot E, Duval J, Courvalin P. Plasmid-mediated resistance to vancomycin and teicoplanin in Enterococcus faecium. N Engl J Med. 1988;319(3):157–61. doi:10.1056/NEJM198807213190307.

12. Uttley AH, Collins CH, Naidoo J, George RC. Vancomycin-resistant enterococci. Lancet. 1988;1(8575–6):57–8. doi: http://dx.doi.org/10.1016/S0140-6736(88)92993-5.

13. Arias CA, Contreras GA, Murray BE. Management of multidrug-resistant enterococcal infections. Clin Microbiol Infect. 2010;16(6):555– 62. doi:10.1111/j.1469-0691.2010.03214.x.

14. Napolitano LM. Emerging issues in the diagnosis and management of infections caused by multi-drug-resistant, gram-positive cocci. Surg Infect (Larchmt). 2005;6 Suppl 2:S-5–22. doi:10.1089/sur.2005.6.s2-5.

15. Богомолова НС, Большаков ЛВ, Кузнецова СМ, Орешкина ТД. Динамика устойчивости к антибиотикам и частота выделения стафилококков и энтерококков у больных отделений реконструктивной хирургии. Антибиотики и химиотерапия. 2011;56(5–6):37–45.

16. Patel R. Clinical impact of vancomycin-resistant enterococci. J Antimicrob Chemother. 2003;51 Suppl 3:iii13–21. doi:10.1093/jac/dkg272.

17. Capita R, Alonso-Calleja C. Antibiotic-resistant bacteria: a challenge for the food industry. Crit Rev Food Sci Nutr. 2013;53(1):11–48. doi:10.1080/10408398.2010.519837.

18. Xu HT, Tian R, Chen DK, Xiao F, Nie ZY, Hu YJ, Zhang XZ, Li JM. Nosocomial spread of hospital-adapted CC17 vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a tertiary-care hospital of Beijing, China. Chin Med J (Engl). 2011;124(4):498–503.

19. Ozawa Y, Tanimoto K, Nomura T, Yoshinaga M, Arakawa Y, Ike Y. Vancomycin-resistant enterococci in humans and imported chickens in Japan. Appl Environ Microbiol. 2002;68(12):6457– 61. doi:10.1128/AEM.68.12.6457-6461.2002.

20. Freitas AR, Coque TM, Novais C, Hammerum AM, Lester CH, Zervos MJ, Donabedian S, Jensen LB, Francia MV, Baquero F, Peixe L. Human and swine hosts share vancomycin-resistant Enterococcus faecium CC17 and CC5 and Enterococcus faecalis CC2 clonal clusters harboring Tn1546 on indistinguishable plasmids. J Clin Microbiol. 2011;49(3):925–31.doi:10.1128/JCM.01750-10.

21. Hammerum AM, Fussing V, Aarestrup FM, Wegener HC. Characterization of vancomycin-resistant and vancomycin-susceptible Enterococcus faecium isolates from humans, chickens and pigs by RiboPrinting and pulsedfield gel electrophoresis. J Antimicrob Chemother. 2000;45(5):677–80.

22. Kühn I, Iversen A, Finn M, Greko C, Burman LG, Blanch AR, Vilanova X, Manero A, Taylor H, Caplin J, Domínguez L, Herrero IA, Moreno MA, Möllby R. Occurrence and relatedness of vancomycin-resistant enterococci in animals, humans, and the environment in different European regions. Appl Environ Microbiol. 2005;71(9):5383–90. doi:10.1128/AEM.71.9.5383-5390.2005.

23. Dutka-Malen S, Evers S, Courvalin P. Detection of glycopeptide resistance genotypes and identification to the species level of clinically relevant enterococci by PCR. J Clin Microbiol. 1995;33(1):24–7.

24. Poeta P, Costa D, Klibi N, Rodrigues J, Torres C. Phenotypic and genotypic study of gelatinase and beta-haemolysis activities in faecal enterococci of poultry in Portugal. J Vet Med B Infect Dis Vet Public Health. 2006;53(5):203–8. doi:10.1111/j.1439-0450.2006.00941.x.

25. Champagne J, Diarra MS, Rempel H. Development of a DNA microarray for enterococcal species, virulence, and antibiotic resistance gene determinations among isolates from poultry. Appl Environ Microbiol. 2011;77(8): 2625–33. doi:10.1128/AEM.00263-11.

26. Страчунский ЛС, Козлов СН. Современная антимикробная химиотерапия. Руководство для врачей. М.: Боргес; 2002. 432 с.

27. Kaszanyitzky EJ, Tenk M, Ghidán A, Fehérvári GY, Papp M. Antimicrobial susceptibility of enterococci strains isolated from slaughter animals on the data of Hungarian resistance monitoring system from 2001 to 2004. Int J Food Microbiol. 2007;115(1):119–23. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2006.10.004.

28. Reynolds PE, Courvalin P. Vancomycin resistance in enterococci due to synthesis of precursors terminating in D-alanyl-D-serine. Antimicrob Agents Chemother. 2005;49(1):21–5. doi:10.1128/AAC.49.1.21-25.2005.

29. Ramotar K, Woods W, Larocque L, Toye B. Comparison of phenotypic methods to identify enterococci intrinsically resistant to vancomycin (VanC VRE). Diagn Microbiol Infect Dis. 2000;36(2):119–24. doi: http://dx.doi.org/10.1016/S0732-8893(99)00126-1.

30. Schwaiger K, Bauer J, Hörmansdorfer S, Mölle G, Preikschat P, Kämpf P, Bauer-Unkauf I, Bischoff M, Hölzel C. Presence of the resistance genes vanC1 and pbp5 in phenotypically vancomycin and ampicillin susceptible Enterococcus faecalis. Microb Drug Resist. 2012;18(4): 434–9. doi:10.1089/mdr.2011.0227.

31. Moura TM, Cassenego AP, Campos FS, Ribeiro AM, Franco AC, d'Azevedo PA, Frazzon J, Frazzon AP. Detection of vanC1 gene transcription in vancomycin-susceptible Enterococcus faecalis. Mem Inst Oswaldo Cruz. 2013;108(4):453–6. doi:10.1590/S0074-0276108042013009.

32. de Garnica ML, Valdezate S, Gonzalo C, Saez-Nieto JA. Presence of the vanC1 gene in a vancomycin-resistant Enterococcus faecalis strain isolated from ewe bulk tank milk. J Med Microbiol. 2013;62(Pt 3):494–5. doi:10.1099/jmm.0.052274-0.

33. Sun M, Wang Y, Chen Z, Zhu X, Tian L, Sun Z. The first report of the vanC₁ gene in Enterococcus faecium isolated from a human clinical specimen. Mem Inst Oswaldo Cruz. 2014;109(6): 712–5. doi: http://dx.doi.org/10.1590/0074-0276140019.


Дополнительные файлы

1. Table 1. The numbers of Enterococcus spp. isolates with various sensitivity to antimicrobial agents
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Посмотреть (136KB)    
Метаданные
2. Table 2. Minimal inhibitory concentration of vancomycin for Enterococcus spp. isolates with vancomycin resistance genes and for the reference strains
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Посмотреть (173KB)    
Метаданные
3. Table 3. Sensitivity of Enterococcus spp. isolates with vanC-genes to antimicrobial agents of various functional classes
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Посмотреть (116KB)    
Метаданные

Для цитирования:


Светоч Э.А., Теймуразов М.Г., Тазина О.И., Абаимова А.А., Лев А.И., Асташкин Е.И., Леонова Е.С., Карцев Н.Н., Детушев К.В., Ерусланов Б.В., Дятлов И.А., Фурсова Н.К. Антибиотикорезистентность культур Enterococcus spp., выделенных от промышленной птицы в 2013–2016 гг. в хозяйствах Российской Федерации, и детекция у них генов резистентности к ванкомицину. Альманах клинической медицины. 2017;45(2):138-146. https://doi.org/10.18786/2072-0505-2017-45-2-138-146

For citation:


Svetoch E.A., Teymurazov M.G., Tazina O.I., Abaimova A.A., Lev A.I., Astashkin E.I., Leonova E.S., Kartsev N.N., Detushev K.V., Eruslanov B.V., Dyatlov I.A., Fursova N.K. Antibacterial resistance of Enterococcus spp. isolated from commercial poultry of the Russian Federation farms in 2013–2016, and identification of vancomycin resistance genes. Almanac of Clinical Medicine. 2017;45(2):138-146. (In Russ.) https://doi.org/10.18786/2072-0505-2017-45-2-138-146

Просмотров: 2775


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-0505 (Print)
ISSN 2587-9294 (Online)