Preview

Альманах клинической медицины

Расширенный поиск

Гиперметилирование генов микроРНК miR-124, miR-125b, miR-127 и miR-129 в карциноме яичников вовлечено в подавление их экспрессии и ассоциировано как с развитием, так и с прогрессией рака яичников

https://doi.org/10.18786/2072-0505-2019-47-003

Полный текст:

Аннотация

Обоснование. Ранее нами определена группа генов микроРНК (MIR-107, MIR-1258, MIR-130b, MIR-34b/c, MIR-9-1, MIR-9-3 и др.), метилирование которых вовлечено в развитие и прогрессию рака яичников. Цель – расширить спектр генов микроРНК, гиперметилируемых при раке яичников, и изучить роль этой модификации в патогенезе и прогрессии рака яичников. Материал и методы. Исследование выполнено на выборке из 76 образцов рака яичников и 13 перитонеальных метастазах. Использовали метод бисульфитной конверсии ДНК с последующей метилспецифичной полимеразной цепной реакцией (ПЦР) для оценки статуса метилирования генов микроРНК и количественную ПЦР в реальном времени для оценки уровня их экспрессии. Результаты. Показано значимое повышение частот метилирования в образцах опухолей в сравнении с гистологически неизмененной тканью яичников для 6 исследованных генов микроРНК: MIR-124-1, MIR-124-2, MIR-124-3, MIR-125B-1, MIR-127, MIR-129-2 (p ≤ 10-3). Установлено подавление уровня экспрессии 4 микроРНК (miR-124-3p, miR-125b-5p, miR-127-5p, miR-129-5p), кодируемых этими генами, и значимая корреляция между изменениями уровней их экспрессии и метилированием генов (rs = 0,63–0,94, p ≤ 10-4). Кроме того, выявлены статистически значимые ассоциации метилирования 5 генов (MIR-124-2, MIR-124-3, MIR-125B-1, MIR-127, MIR-129-2) с параметрами прогрессии рака: с клинической стадией, метастазированием, а также с размером и степенью инвазии опухоли, и в меньшей мере – со снижением степени дифференцировки. Связь с метастазированием 5 генов микроРНК подтверждена при анализе перитонеальных макрометастазов от 13 пациенток. Заключение. Продемонстрировано функциональное значение аберрантного метилирования группы генов микроРНК в подавлении их экспрессии в карциномах  яичников. Показана ассоциация гиперметилирования генов микроРНК с прогрессией рака яичников, включая метастазирование в брюшину.

Об авторах

Э. А. Брага
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии», ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия

д-р биол. наук, профессор, гл. науч. сотр., заведующая лабораторией патогеномики и транскриптомики; вед. науч. сотр. лаборатории молекулярной генетики сложно наследуемых заболеваний
125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8, Российская Федерация.
+7 (917) 545 43 93.



И. В. Пронина
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»
Россия

канд. биол. наук, науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8, Российская Федерация



Д. О. Уткин
ФГБОУ ВО «Московский государственный медико-стоматологический университет имени А.И. Евдокимова»
Россия

врач-хирург, соискатель кафедры клинической биохимии и лабораторной диагностики факультета дополнительного профессионального образования

127473, г. Москва, ул. Делегатская, 20–1, Российская Федерация



Е. А. Филиппова
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»
Россия

аспирант, мл. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

г. Москва, ул. Балтийская, 8, Российская Федерация



А. М. Бурденный
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»
Россия

канд. биол. наук, вед. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики

125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8, Российская Федерация



В. И. Логинов
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии»; ФГБНУ «Медико-генетический научный центр»
Россия

канд. биол. наук, вед. науч. сотр. лаборатории патогеномики и транскриптомики; ст. науч. сотр. лаборатории молекулярной генетики сложно наследуемых заболеваний

125315, г. Москва, ул. Балтийская, 8, Российская Федерация

 115522, г. Москва, ул. Москворечье, 1, Российская Федерация



М. В. Фридман
ФГБУН «Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова» РАН
Россия

канд. биол. наук, науч. сотр. лаборатории системной биологии и вычислительной генетики

119333, г. Москва, ул. Губкина, 3, Российская Федерация



Т. П. Казубская
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина»
Россия

д-р мед. наук, врач-онкогенетик, ст. науч. сотр. лаборатории клинической онкогенетики

115478, г. Москва, Каширское шоссе, 24, Российская Федерация



Н. Е. Кушлинский
ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина»
Россия

д-р мед. наук, профессор, чл.-корр. РАН, заведующий лабораторией клинической биохимии

115478, г. Москва, Каширское шоссе, 24, Российская Федерация



Список литературы

1. Логинов ВИ, Рыков СВ, Фридман МВ, Брага ЭА. Метилирование генов микрорнк и онкогенез (обзор). Биохимия. 2015;80(2): 184–203.

2. Kinose Y, Sawada K, Nakamura K, Kimura T. The role of microRNAs in ovarian cancer. Biomed Res Int. 2014;2014:249393. doi: 10.1155/2014/249393.

3. Брага ЭА, Фридман МВ, Кушлинский НЕ. Молекулярные механизмы в метастазировании рака яичников: ключевые гены и регуляторные микроРНК. Биохимия. 2017;82(5): 717–31.

4. Shi M, Mu Y, Zhang H, Liu M, Wan J, Qin X, Li C. MicroRNA-200 and microRNA-30 family as prognostic molecular signatures in ovarian cancer: A meta-analysis. Medicine (Baltimore). 2018;97(32):e11505. doi: 10.1097/MD.0000000000011505.

5. Kunej T, Godnic I, Ferdin J, Horvat S, Dovc P, Calin GA. Epigenetic regulation of microRNAs in cancer: an integrated review of literature. Mutat Res. 2011;717(1–2): 77–84. doi: 10.1016/j.mrfmmm.2011.03.008.

6. Piletič K, Kunej T. MicroRNA epigenetic signatures in human disease. Arch Toxicol. 2016;90(10): 2405–19. doi: 10.1007/s00204-016-1815-7.

7. Weisenberger DJ, Liang G, Lenz HJ. DNA methylation aberrancies delineate clinically distinct subsets of colorectal cancer and provide novel targets for epigenetic therapies. Oncogene. 2018;37(5): 566–77. doi: 10.1038/onc.2017.374.

8. Li X, Pan Q, Wan X, Mao Y, Lu W, Xie X, Cheng X. Methylation-associated Has-miR-9 deregulation in paclitaxel-resistant epithelial ovarian carcinoma. BMC Cancer. 2015;15:509. doi: 10.1186/s12885-015-1509-1.

9. Брага ЭА, Логинов ВИ, Бурденный АМ, Филиппова ЕА, Пронина ИВ, Куревлев СВ, Казубская ТП, Кушлинский ДН, Уткин ДО, Ермилова ВД, Кушлинский НЕ. Пять гиперметилированных генов микрорнк как потенциальные маркеры рака яичников. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2017;164(9): 335–40

10. Kurman RJ, Carcangiu ML, Herrington CS, Young RH, editors. WHO - Classification of Tumours of Female Reproductive Organs. Vol. 6. Lyon: IARC; 2014. 307 p.

11. Pronina IV, Loginov VI, Burdennyy AM, Fridman MV, Senchenko VN, Kazubskaya TP, Kushlinskii NE, Dmitriev AA, Braga EA. DNA methylation contributes to deregulation of 12 cancer-associated microRNAs and breast cancer progression. Gene. 2017;604:1–8. doi: 10.1016/j.gene.2016.12.018.

12. Schrijver WA, van Diest PJ; Dutch Distant Breast Cancer Metastases Consortium, Moelans CB. Unravelling site-specific breast cancer metastasis: a microRNA expression profiling study. Oncotarget. 2017;8(2): 3111–23. doi: 10.18632/oncotarget.13623.

13. Drasin DJ, Guarnieri AL, Neelakantan D, Kim J, Cabrera JH, Wang CA, Zaberezhnyy V, Gasparini P, Cascione L, Huebner K, Tan AC, Ford HL. TWIST1-Induced miR-424 Reversibly Drives Mesenchymal Programming while Inhibiting Tumor Initiation. Cancer Res. 2015;75(9): 1908–21. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-14-2394.


Дополнительные файлы

1. Table 1.Clinical and histological characteristics of the main series of 76 primary tumor samples and additional set taken from 13 primary tumors and peritoneal metastases
Тема
Тип Прочее
Посмотреть (64KB)    
Метаданные
2. Table 2.Methylation frequencies of 6 microRNA genes in the ovarian carcinoma
Тема
Тип Прочее
Посмотреть (56KB)    
Метаданные
3. Table 3.Frequencies of abnormal expression of 4 microRNAs in ovarian carcinoma
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Посмотреть (47KB)    
Метаданные
4. Table 4. Аssociations of methylation of 6 microRNA genes with progression of ovarian cancer
Тема
Тип Исследовательские инструменты
Посмотреть (68KB)    
Метаданные

Для цитирования:


Брага Э.А., Пронина И.В., Уткин Д.О., Филиппова Е.А., Бурденный А.М., Логинов В.И., Фридман М.В., Казубская Т.П., Кушлинский Н.Е. Гиперметилирование генов микроРНК miR-124, miR-125b, miR-127 и miR-129 в карциноме яичников вовлечено в подавление их экспрессии и ассоциировано как с развитием, так и с прогрессией рака яичников. Альманах клинической медицины. 2019;47(1):47-53. https://doi.org/10.18786/2072-0505-2019-47-003

For citation:


Braga E.A., Pronina I.V., Utkin D.O., Filippova E.A., Burdennyy A.M., Loginov V.I., Fridman M.V., Kazubskaya T.P., Kushlinskii N.E. Hypermethylation of the microRNA miR-124, miR-125b, miR-127, and miR-129 in ovarian carcinoma is involved in suppression of their expression and associated with both the development and progression of ovarian cancer. Almanac of Clinical Medicine. 2019;47(1):47-53. (In Russ.) https://doi.org/10.18786/2072-0505-2019-47-003

Просмотров: 60


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2072-0505 (Print)
ISSN 2587-9294 (Online)